In der Abteilung Zentrale Verwaltung des Instituts werden die klassischen Verwaltungsaufgaben "Personal", "Haushalt und Beschaffung", "Bau und Technik", "Innerer Dienst" und "Organisationsentwicklung" durch einzelne Referate wahrgenommen. Außerdem ist hier die Vertrauensstelle Implantateregister und Gesundheitsdaten angesiedelt.