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FG 11 Bakterielle darmpathogene Erreger und Legionellen

Leitung:
Antje Flieger
Vertretung:
Angelika Fruth

Im Fachgebiet 11 werden wichtige, durch Lebensmittel und Wasser übertragene humanpathogene bakterielle Erreger wie Salmonella (S.) enterica, Escherichia (E.) coli, Campylobacter, Listeria monocytogenes, Yersinia spp., Shigellen und der Lungenpathogen Legionella bearbeitet. Für andere Enterobacteriaceaen werden im RKI-Fachgebiet "Bakterielle darmpathogene Erreger und Legionellen" und für Vibrio cholerae im RKI-Fachgebiet Hochpathogene mikrobielle Erreger (ZBS2) diagnostische Methoden (Taxonomie und Ausbruchsanalyse) vorgehalten.

Das Fachgebiet "Bakterielle darmpathogene Erreger und Legionellen" beschäftigt sich mit der laborgestützten epidemiologischen Überwachung von relevanten Gastroenteritis-Erregern, der molekularen Analyse des Erregerwandels und -wechsels, des "Auf und Ab" von Epidemieklonen und der Antibiotika-Resistenzentwicklung. Darüber hinaus werden Virulenz- und Persistenzstrategien dieser Erreger sowie von Legionellen untersucht.

Am Fachgebiet 11 sind das Nationale Referenzzentrum (NRZ) für Salmonellen und andere bakterielle Enteritiserreger und das Konsiliarlabor für Listerien angesiedelt. Diese stehen dem Öffentlichen Gesundheitsdienst (ÖGD) und niedergelassenen Ärzten für Beratungen, Diagnostik, Schaffung von Indizienbeweisen und Hilfestellungen für die epidemiologische Aufklärung von Infektionen zur Verfügung.

Aufgaben

  • Verfolgen des Auftretens und der Ausbreitung von Salmonella- und Enterohämolytischen E. coli (EHEC)-Infektionen
  • Laborgestützte Ausbruchsanalyse insbesondere bei Erkrankungen durch Infektionen mit bakteriellen Gastroenteritiserregern einschließlich Erregern von Typhus und Paratyphus sowie epidemiologische Auswertung in Zusammenarbeit mit dem RKI-Fachgebiet Gastroenterologische Infektionen, Zoonosen und tropische Infektionen
  • Sub- und Feintypisierung der Erreger mittels klassischer, molekularer und genombasierter Methoden zum Zweck der Überwachung der Erregerpopulation (Erregerwandel)
  • Identifizierung von Merkmalen und Indikatoren für die verbesserte Diagnostik (siehe Nationales Referenzzentrum für Salmonellen und andere bakterielle Enteritiserreger)
  • Analyse der Resistenzentwicklung für ausgewählte Gastroenteritiserreger
  • Analyse der Pathogenität und der epidemischen Virulenz bakterieller Erreger, insbesondere der Virulenzgenprofile und der sekretierten Proteine
  • Analyse von Persistenzstrategien bakterieller Pathogene, z.B. des Viable But Not Culturable (VBNC)-Status von Bakterien und Besiedlung potentieller Reservoire in Protozoen

Projekte

Stand: 19.11.2020

Ausgewählte Publikationen

  • Fischer MA, Wamp S, Fruth A, Allerberger F, Flieger A, Halbedel S (2020): Population structure-guided profiling of antibiotic resistance patterns in clinical Listeria monocytogenes isolates from Germany identifies pbpB3 alleles associated with low levels of cephalosporin resistance.
    Emerg. Microbes Infect. 9 (1): 1804-1813. Epub Jul 21. doi: 10.1080/22221751.2020.1799722. mehr

  • Banerji S, Simon S, Tille A, Fruth A, Flieger A (2020): Genome-based Salmonella serotyping as the new gold standard.
    Sci. Rep. 10 (1): 4333. Epub Mar 9. doi: 10.1038/s41598-020-61254-1. mehr

  • Halbedel S, Wilking H, Holzer A, Kleta S, Fischer MA, Lüth S, Pietzka A, Huhulescu S, Lachmann R, Krings A, Ruppitsch W, Leclercq A, Kamphausen R, Meincke M, Wagner-Wiening C, Contzen M, Kraemer IB, Al Dahouk S, Allerberger F, Stark K, Flieger A (2020): Large nationwide outbreak of invasive listeriosis associated with blood sausage, Germany, 2018–2019.
    Emerg. Infect. Dis. 26 (7): 1456–1464. Epub Jun 10. doi: 10.3201/eid2607.200225. mehr

  • Mühlen S, Ramming I, Pils MC, Koeppel M, Glaser J, Leong J, Flieger A et al. (2020): Identification of antibiotics that diminish disease in a murine model of enterohemorrhagic Escherichia coli infection.
    Antimicrob. Agents Chemother. 64 (4): e02159-19. Epub Feb 3. doi: 10.1128/AAC.02159-19. mehr

  • Wamp S, Rutter ZJ, Rismondo J, Jennings CE, Möller L, Lewis RJ, Halbedel S (2020): PrkA controls peptidoglycan biosynthesis through the essential phosphorylation of ReoM.
    eLife 9: e56048. Epub May 29. doi: 10.7554/eLife.56048. mehr

  • Cleverley RM, Rutter ZJ, Rismondo J, Corona F, Tsui HT, Alatawi FA, Daniel RA, Halbedel S et al. (2019): The cell cycle regulator GpsB functions as cytosolic adaptor for multiple cell wall enzymes.
    Nat. Commun. 10 (1): 261. Epub Jan 16. doi: 10.1038/s41467-018-08056-2. mehr

  • Lang C, Hiller M, Konrad R, Fruth A, Flieger A (2019): Whole-Genome-Based Public Health Surveillance of Less Common Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Serovars and Untypeable Strains Identifies Four Novel O Genotypes.
    J. Clin. Microbiol. 57 (10): e00768-19. Epub Jul 31. doi: 10.1128/JCM.00768-19. mehr

  • Halbedel S, Prager R, Banerji S, Kleta S, Trost E, Nishanth G, Alles G, Hölzel C, Schlesiger F, Pietzka A, Schlüter D, Flieger A (2019): A Listeria monocytogenes ST2 clone lacking chitinase ChiB from an outbreak of non-invasive gastroenteritis.
    Emerg. Microbes Infect. 8 (1): 17–28. Epub Jan 19. doi: 10.1080/22221751.2018.1558960. mehr

  • Hauf S, Herrmann J, Miethke M, Gibhardt J, Commichau FM, Müller R, Fuchs S, Halbedel S (2019): Aurantimycin resistance genes contribute to survival of Listeria monocytogenes during life in the environment.
    Mol. Microbiol. 111 (4): 1009-1024. Epub Jan 15. doi: 10.1111/mmi.14205. mehr

  • Renfert K, Rabsch W, Fruth A et al. (2019): The use of a salmonella bacteriophage in bearded dragons: application, passage time and reisolation.
    Tierarztl. Prax. Ausg. K Kleintiere Heimtiere 47 (4): 247–256. Epub Aug 21. doi: 10.1055/a-0959-5528. mehr

  • Aurass P, Düvel J, Karste S, Nübel U, Rabsch W, Flieger A (2018): glnA truncation in Salmonella enterica results in a small colony variant phenotype, attenuated host cell entry, and reduced expression of flagellin and SPI-1 associated effector genes
    Appl. Environ. Microbiol. 84 (2): e01838-17. Epub 2017 Nov 17. doi: 10.1128/AEM.01838-17. mehr

  • Eichhorn I, Heidemanns K, Ulrich RG, Schmidt H, Semmler T, Fruth A, Bethe A, Goulding D, Pickard D, Karch H, Wieler LH (2018): Lysogenic conversion of atypical enteropathogenic Escherichia coli (aEPEC) from human, murine, and bovine origin with bacteriophage Φ3538 Δstx2::cat proves their enterohemorrhagic E. coli (EHEC) progeny
    Int. J. Med. Microbiol. 308 (7): 890-898. Epub Jun 19. doi: 10.1016/j.ijmm.2018.06.005. mehr

  • Flieger A, Frischknecht F et al. (2018): Pathways of host cell exit by intracellular pathogens
    Microb. Cell. 5 (12): 525–544. Epub Oct 18. doi: 10.15698/mic2018.12.659. mehr

  • Halbedel S, Prager R, Fuchs S, Trost E, Werner G, Flieger A (2018): Whole genome sequencing of recent Listeria monocytogenes isolates from Germany reveals population structure and disease clusters
    J. Clin. Microbiol. 56 (6): pii: e00119-18. Epub Apr 11. doi: 10.1128/JCM.00119-18. mehr

  • Hiller M, Lang C, Michel W, Flieger A (2018): Secreted phospholipases of the lung pathogen Legionella pneumophila
    Int. J. Med. Microbiol. 308 (1): 168-175. Epub 2017 Oct 28. doi: 10.1016/j.ijmm.2017.10.002. mehr

  • Lang C, Fruth A, Holland G, Laue M, Mühlen S, Dersch P, Flieger A (2018): Novel type of pilus associated with a Shiga-toxigenic E. coli hybrid pathovar conveys aggregative adherence and bacterial virulence
    Emerg. Microbes Infect. 7 (1): 203. Epub Dec 5. doi: 10.1038/s41426-018-0209-8. mehr

  • Simon S, Trost E, Bender JK, Fuchs S, Malorny B, Rabsch W, Prager R, Tietze E, Flieger A (2018): Evaluation of WGS based approaches for investigating a food-borne outbreak caused by Salmonella enterica serovar Derby in Germany
    Food Microbiol. 71: 46-54. Epub 2017 Aug 25. doi: 10.1016/j.fm.2017.08.017. mehr

  • Kunstmann S, Scheidt T, Buchwald S, Helm A, Mulard LA, Fruth A, Barbirz S (2018): Bacteriophage Sf6 tailspike protein for detection of Shigella flexneri pathogens
    Viruses 10 (8): pii: E431. Epub Aug 15. doi: 10.3390/v10080431. mehr

  • Bielaszewska M, Rüter C, Bauwens A, Greune L, Jarosch KA, Steil D, Zhang W, He X, Lloubes R, Fruth A et al. (2017): Host cell interactions of outer membrane vesicle-associated virulence factors of enterohemorrhagic Escherichia coli O157: Intracellular delivery, trafficking and mechanisms of cell injury
    PLoS Pathog. 13 (2): e1006159. Epub Feb 3. doi: 10.1371/journal.ppat.1006159. mehr

  • Lang C, Hiller M, Flieger A (2017): Disulfide loop cleavage of Legionella pneumophila PlaA boosts lysophospholipase A activity
    Sci. Rep. 7 (1): 16313. Epub Nov 24. doi: 10.1038/s41598-017-12796-4. mehr

  • Aurass P, Gerlach T, Becher D, Voigt B, Karste S, Bernhardt J, Riedel K, Hecker M, Flieger A (2016): Life stage-specific proteomes of Legionella pneumophila reveal a highly differential abundance of virulence-associated Dot/Icm effectors
    Mol. Cell. Proteomics 15 (1): 177-200. Epub 2015 Nov 6. doi: 10.1074/mcp.M115.053579. mehr

  • Flores-Díaz M, Monturiol-Gross L, Naylor C, Alape-Girón A, Flieger A (2016): Bacterial sphingomyelinases and phospholipases as virulence factors
    Microbiol. Mol. Biol. Rev. 80 (3): 597–628. Epub Jun 15. doi: 10.1128/MMBR.00082-15. mehr

  • Arvand M, Bettge-Weller G, Fruth A, Uphoff H, Pfeifer Y (2015): Extended-spectrum beta-lactamase-producing Shiga toxin gene (stx1)-positive Escherichia coli O91:H14 carrying blaCTX-M-15 on an IncI1-ST31 plasmid isolated from a human patient in Germany
    Int. J. Med. Microbiol. 305 (3): 404–407. Epub Mar 6. doi: 10.1016/j.ijmm.2015.03.003. mehr

  • Fruth A, Prager R, Tietze E, Rabsch W, Flieger A (2015): Molecular epidemiological view on Shiga toxin-producing Escherichia coli causing human disease in Germany: Diversity, prevalence, and outbreaks
    Int. J. Med. Microbiol. 305 (7): 697-704. Epub Aug 21. doi: 10.1016/j.ijmm.2015.08.020. mehr

  • Tietze E, Dabrowski PW, Prager R, Radonić A, Fruth A, Aurass P, Nitsche A, Mielke M, Flieger A (2015): Comparative genomic analysis of two novel sporadic shiga toxin-producing Escherichia coli O104:H4 strains isolated 2011 in Germany
    PLoS ONE 10 (4): e0122074. Epub Apr 2. doi: 10.1371/journal.pone.0122074. mehr

  • Vorwerk H, Huber C, Mohr J, Bunk B, Bhuju S, Wensel O, Spröer C, Fruth A, Flieger A et al. (2015): A transferable plasticity region in Campylobacter coli allows isolates of an otherwise non-glycolytic food-borne pathogen to catabolize glucose
    Mol. Microbiol. 98 (5): 809-830. Epub Aug 11. doi: 10.1111/mmi.13159. mehr

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