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Nationales Referenzzentrum für Salmonellen und andere bakterielle Enteritiserreger

Leitung:
Antje Flieger
Vertretung:
Angelika Fruth

Das Nationale Referenzzentrum (NRZ) für Salmonellen und andere bakterielle Enteritiserreger bearbeitet wichtige humanpathogene, durch Lebensmittel übertragene bakterielle Erreger, wie Salmonella (S.) enterica, Escherichia (E.) coli (EHEC/STEC), Campylobacter (C). spp., Yersinia (Y.) enterocolitica, Y. pseudotuberculosis und Shigella (Sh.) spp. Außerdem wurde das NRZ 2009 zum Partner des binationalen Konsiliarlabors (KL) Listerien an der Österreichischen Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit GmbH (AGES) in Wien berufen. Seit November 2011 ist das NRZ nach DIN/EN 15189 und 17025 akkreditiert.

Aufgaben

Salmonellen und Campylobacter sind mit je mehreren Zehntausend gemeldeten Infektionen pro Jahr die häufigste Ursache für eine bakterielle Enteritis in Deutschland. Die entsprechenden Infektionszahlen für EHEC-Infektionen liegen bei ca. 2000 pro Jahr. In der Größenordnung von ca. 3000 Fällen liegen die gemeldeten Infektionszahlen für Y. enterocolitica, während Shigella- und Listeria-Infektionen eine Fallzahl von 600 pro Jahr aufweisen (mit steigender Tendenz).

Die Möglichkeit schwerer Komplikationen mit Hospitalisierung bei Infektionen mit Typhus- und Paratyphus-Erregern (und selten auch bei Enteritis-Salmonellen), mit EHEC (Hämolytisch-urämisches Syndrom, HUS), mit Y. enterocolitica (Arthritiden) und mit Campylobacter (Guillan-Barré-Syndrom) erfordert eine eingehende Erforschung der Eigenschaften dieser Erreger.

Für die genannten Erreger wird im Rahmen des NRZ an der Entwicklung bzw. Verbesserung diagnostischer und Typisierverfahren gearbeitet. Außerdem werden über die Basistypisierung hinausreichende Sub- und Feintypisierungen zur Aufklärung von epidemischen Prozessen und Erregerquellen durchgeführt. Epidemiologische Analysen und Bewertungen der Resistenz- und Virulenzentwicklung tragen zum Verständnis von Veränderungen in der Erregerpopulation bei. Das Führen einer Stammsammlung ermöglicht die Abgabe von Referenzstämmen bzw. diagnostikspezifischen Referenzpräparaten.

Stand: 19.11.2020

Ausgewählte Publikationen

  • Uelze L, Borowiak M, Flieger A, Simon S et al. (2020): Complete genome sequence of Salmonella enterica subsp. diarizonae serovar 61:k:1,5,(7) strain 14-SA00836-0, isolated from human urine.
    Microbiol. Resour. Announc. 9 (36): e00683-20. Epub Sep 3. doi: 10.1128/MRA.00683-20. mehr

  • Banerji S, Simon S, Tille A, Fruth A, Flieger A (2020): Author Correction: Genome-based Salmonella serotyping as the new gold standard.
    Sci. Rep. 10 (1): 10776. Epub Jun 26. doi: 10.1038/s41598-020-67917-3. mehr

  • Munck N, Leekitcharoenphon P, Litrup E, Kaas R, Meinen A, Guillier L, Tang Y, Malorny B, Palma F, Borowiak M, Gourmelon M, Simon S, Banerji S et al. (2020): Four European Salmonella Typhimurium datasets collected to develop WGS-based source attribution methods.
    Sci. Data 7 (1): 75. Epub Mar 3. doi: 10.1038/s41597-020-0417-7. mehr

  • Rödel J, Edel B, Braun SD, Ehricht R, Simon S, Fruth A, Löffler B (2020): Simple differentiation of Salmonella Typhi, Paratyphi and Choleraesuis from Salmonella species using the eazyplex TyphiTyper LAMP assay.
    J. Med. Microbiol. 69 (6): 817-823. Epub May 27. doi: 10.1099/jmm.0.001201. mehr

  • Enkelmann J, Gassowski M, Nielsen S, Wenz B, Ross S, Marcus U, Bremer V, Zimmermann R; DRUCK-Study group (also for RKI Bock CT, Bannert N, Santos-Hövener C) (2020): High prevalence of hepatitis C virus infection and low level of awareness among people who recently started injecting drugs in a cross-sectional study in Germany, 2011–2014: missed opportunities for hepatitis C testing.
    Harm Reduct. J. 17 (1): 7. Epub Jan 10. doi: 10.1186/s12954-019-0338-y. mehr

  • Meinen A, Simon S, Banerji S, Szabo I, Malorny B, Borowiak M, Hadziabdic S, Becker N, Luber P, Lohr D, Harms C, Plenge-Bönig A, Mellou K, Mandilara G, Mossong J, Ragimbeau C, Weicherding P, Hau P, Dědičová D, Šafaříková L, Nair S, Dallman TJ, Larkin L, McCormick J, De Pinna E, Severi E, Kotila S, Niskanen T, Rizzi V, Deserio D, Flieger A, Stark K (2019): Salmonellosis outbreak with novel Salmonella enterica subspecies enterica serotype (11:z41:e,n,z15) attributable to sesame products in five European countries, 2016 to 2017.
    Euro Surveill. 24 (36): 1800543. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2019.24.36.1800543. mehr

  • Lang C, Hiller M, Konrad R, Fruth A, Flieger A (2019): Whole-Genome-Based Public Health Surveillance of Less Common Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Serovars and Untypeable Strains Identifies Four Novel O Genotypes.
    J. Clin. Microbiol. 57 (10): e00768-19. Epub Jul 31. doi: 10.1128/JCM.00768-19. mehr

  • Renfert K, Rabsch W, Fruth A et al. (2019): The use of a salmonella bacteriophage in bearded dragons: application, passage time and reisolation.
    Tierarztl. Prax. Ausg. K Kleintiere Heimtiere 47 (4): 247–256. Epub Aug 21. doi: 10.1055/a-0959-5528. mehr

  • Dekker D, Eibach D, Boahen KG, Akenten CW, Pfeifer Y, Zautner AE, Mertens E, Krumkamp R, Jaeger A, Flieger A et al. (2019): Fluoroquinolone-resistant Salmonella enterica, Campylobacter spp., and Arcobacter butzleri from local and imported poultry meat in Kumasi, Ghana.
    Foodborne Pathog. Dis. 16 (5): 352-358. Epub Mar 23. doi: 10.1089/fpd.2018.2562. mehr

  • Mylius M, Dreesman J, Pulz M, Pallasch G, Beyrer K, Claußen K, Allerberger F, Fruth A, Lang C, Prager R, Flieger A et al. (2018): Shiga toxin-producing Escherichia coli O103:H2 outbreak in Germany after school trip to Austria due to raw cow milk, 2017 – The important role of international collaboration for outbreak investigations
    Int. J. Med. Microbiol. 308 (5): 539-544. Epub May 29. doi: 10.1016/j.ijmm.2018.05.005. mehr

  • Simon S, Trost E, Bender JK, Fuchs S, Malorny B, Rabsch W, Prager R, Tietze E, Flieger A (2018): Evaluation of WGS based approaches for investigating a food-borne outbreak caused by Salmonella enterica serovar Derby in Germany
    Food Microbiol. 71: 46-54. Epub 2017 Aug 25. doi: 10.1016/j.fm.2017.08.017. mehr

  • Karnisova L, Marejkova M, Hrbackova H, Mellmann A, Karch H, Fruth A et al. (2018): Attack of the clones: whole genome-based characterization of two closely related enterohemorrhagic Escherichia coli O26 epidemic lineages
    BMC Genomics 19 (1): 647. Epub Aug 31. doi: 10.1186/s12864-018-5045-7. mehr

  • Kunstmann S, Scheidt T, Buchwald S, Helm A, Mulard LA, Fruth A, Barbirz S (2018): Bacteriophage Sf6 tailspike protein for detection of Shigella flexneri pathogens
    Viruses 10 (8): pii: E431. Epub Aug 15. doi: 10.3390/v10080431. mehr

  • Eichhorn I, Semmler T, Mellmann A, Pickard D, Anjum MF, Fruth A, Karch H, Wieler LH (2018): Microevolution of epidemiological highly relevant non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli of serogroups O26 and O111
    Int. J. Med. Microbiol. 308 (8): 1085-1095. Epub Aug 10. doi: 10.1016/j.ijmm.2018.08.003. mehr

  • Vygen-Bonnet S, Rosner BM, Wilking H, Fruth A, Prager R, Kossow A, Lang C, Simon S, Seidel J, Faber M, Schielke A, Michaelis K, Holzer A, Kamphausen R, Kalhöfer D, Thole S, Mellmann A, Flieger A, Stark K (2017): Ongoing haemolytic uraemic syndrome (HUS) outbreak caused by sorbitol-fermenting (SF) Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) O157, Germany, December 2016 to May 2017
    Euro Surveill. 22 (21): pii=30541. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.21.30541. mehr

  • Pietsch M, Eller C, Wendt C, Holfelder M, Falgenhauer L, Fruth A, Grössl T, Leistner R, Valenza G, Werner G, Pfeifer Y; RESET Study Group (2017): Molecular characterisation of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli isolates from hospital and ambulatory patients in Germany
    Vet. Microbiol. 200: 130-137. Epub 2015 Nov 24. doi: 10.1016/j.vetmic.2015.11.028. mehr

  • Schielke A, Takla A, von Kries R, Wichmann O, Hellenbrand W (2017): Marked under-reporting of pertussis requiring hospitalization in infants as estimated by capture-recapture methodology, Germany, 2013–2015
    Pediatr. Infect. Dis. J.: Epub Jul 18. doi: 10.1097/INF.0000000000001698. mehr

  • Kossow A, Zhang W, Bielaszewska M, Rhode S, Hansen K, Fruth A et al. (2016): Molecular characterization of human atypical sorbitol-fermenting enteropathogenic Escherichia coli O157 reveals high diversity
    J. Clin. Microbiol. 54 (5): 1357-1363. Epub Mar 16. doi: 10.1128/JCM.02897-15. mehr

  • Niemann J, Alter T, Gölz G, Tietze E, Fruth A, Rabsch W et al. (2016): Simultaneous occurrence of Salmonella enterica, Campylobacter spp. and Yersinia enterocolitica along the pork production chain from farm to meat processing in five conventional fattening pig herds in Lower Saxony
    Berl. Munch. Tierarztl. Wochenschr. 129 (7-8): 296–303. mehr

  • Schaufler K, Semmler T, Wieler LH, Wöhrmann M, Baddam R, Ahmed N, Müller K, Kola A, Fruth A et al. (2016): Clonal spread and interspecies transmission of clinically relevant ESBL-producing Escherichia coli of ST410 – another successful pandemic clone?
    FEMS Microbiol. Ecol. 92 (1): pii: fiv155. Epub 2015 Dec 10. doi: 10.1093/femsec/fiv155. mehr

  • Alt K, Simon S, Helmeke C, Kohlstock C, Prager R, Tietze E, Rabsch W, Karagiannis I, Werber D, Frank C, Fruth A (2015): Outbreak of uncommon O4 non-agglutinating Salmonella Typhimurium linked to minced pork, Saxony-Anhalt, Germany, January to April 2013
    PLoS One 10 (6): e0128349. Epub Jun 1. doi: 10.1371/journal.pone.0128349. mehr

  • Eichhorn I, Heidemanns K, Semmler T, Kinnemann B, Mellmann A, Harmsen D, Anjum MF, Schmidt H, Fruth A, Valentin-Weigand P, Heesemann J, Suerbaum S, Karch H, Wieler LH (2015): Highly virulent non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) serotypes reflect a similar phylogenetic lineage, giving new insights into the evolution of EHEC
    Appl. Environ. Microbiol. 81 (20): 7041-7047. Epub Jul 31. doi: 10.1128/AEM.01921-15. mehr

  • Vorwerk H, Huber C, Mohr J, Bunk B, Bhuju S, Wensel O, Spröer C, Fruth A, Flieger A et al. (2015): A transferable plasticity region in Campylobacter coli allows isolates of an otherwise non-glycolytic food-borne pathogen to catabolize glucose
    Mol. Microbiol. 98 (5): 809-830. Epub Aug 11. doi: 10.1111/mmi.13159. mehr

  • Arvand M, Bettge-Weller G, Fruth A, Uphoff H, Pfeifer Y (2015): Extended-spectrum beta-lactamase-producing Shiga toxin gene (stx1)-positive Escherichia coli O91:H14 carrying blaCTX-M-15 on an IncI1-ST31 plasmid isolated from a human patient in Germany
    Int. J. Med. Microbiol. 305 (3): 404–407. Epub Mar 6. doi: 10.1016/j.ijmm.2015.03.003. mehr

  • Fruth A, Prager R, Tietze E, Rabsch W, Flieger A (2015): Molecular epidemiological view on Shiga toxin-producing Escherichia coli causing human disease in Germany: Diversity, prevalence, and outbreaks
    Int. J. Med. Microbiol. 305 (7): 697-704. Epub Aug 21. doi: 10.1016/j.ijmm.2015.08.020. mehr

  • Tietze E, Dabrowski PW, Prager R, Radonić A, Fruth A, Aurass P, Nitsche A, Mielke M, Flieger A (2015): Comparative genomic analysis of two novel sporadic shiga toxin-producing Escherichia coli O104:H4 strains isolated 2011 in Germany
    PLoS ONE 10 (4): e0122074. Epub Apr 2. doi: 10.1371/journal.pone.0122074. mehr

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