Das Robert Koch-Institut bietet seit 1996 die Post­graduierten­ausbildung für angewandte Epidemiologie (PAE) an, in der Wissenschaftler im Bereich der Infektions­epidemiologie ausgebildet werden, um epidemiologische Methoden für den Infektions­schutz im Öffentlichen Gesundheits­dienst (ÖGD) einzusetzen. Die PAE ist als Feld­epidemiologie-Trainings­programm eng an das "European Programme for Intervention Epidemiology Training" (EPIET) angebunden. Die Trainings­inhalte sowie die in das Programm eingebundenen Theorie­module werden gemeinsam mit EPIET und dessen Schwester­programm "European Public Health Microbiology Training Programme" (EUPHEM) gestaltet. Die Teil­nehmer der PAE sind daher Teil des EPIET/EUPHEM-Netz­werkes und regelmäßig im engen Austausch mit ihren europäischen Kollegen.

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The ECDC Fellowship Programme is a two-year competency based training with two paths: the field epidemiology path (EPIET) and the public health microbiology path (EUPHEM). The EPIET path offers a curriculum that trains public health experts in competencies for intervention epidemiology and the EUPHEM path provides microbiologists with training in competencies for public health microbiology. After the two-year training EPIET and EUPHEM graduates are considered experts in applying epidemiological or microbiological methods to provide evidence to guide public health interventions for communicable disease prevention and control.

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EUPHEM is a two-year postgraduate qualification programme by ECDC that aims to provide training for scientists with experience in microbiology and a keen interest in public health in the core areas of public health microbiology (PHM). The Robert Koch-Institute has been a training site of EUPHEM since September 2009.

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