Informationen zur Vollgenom-Sequenzierung des Monkeypox Virus

Das Konsiliarlabor für Pockenviren am Robert Koch-Institut bietet an, von ausgewählten Proben das Vollgenom des Monkeypox Virus (MPXV) zu sequenzieren. Die Genomdaten werden pseudonymisiert in die öffentlich zugänglichen Datenbanken NCBI GenBank und GISAID EpiPox geladen und dienen der weiteren Charakterisierung und Risikobewertung der zirkulierenden MPXV. Bislang (Stand 04.03.2024) hat das Konsiliarlabor für Pockenviren 1072 Vollgenom-Sequenzen aus dem seit 2022 andauernden Geschehen in öffentliche Datenbanken gestellt (https://gisaid.org).

Kriterien für die Auswahl einer Probe für die kostenfreie Sequenzierung können beispielsweise besondere klinische Verläufe, epidemiologische Zusammenhänge, die Viruslast und die Verfügbarkeit der Originalprobe sein. Um eine Sequenzierung zu ermöglichen halten Sie bitte VOR der Einsendung der Probe(n) Rücksprache mit dem Konsiliarlabor für Pockenviren unter der Email-Adresse KL-Pocken@rki.de. Für den Fall der Probeneinsendung verwenden Sie bitte den Probenbegleitschein.